Наивысшим достижением в истории клуба считается прохождение в 1/16 Кубка России 2012/2013, где "Локомотив-2" уступил "Мордовии" из Саранска со счетом 0:1. В этом розыгрыше кубка последовательно были обыграны "Знамя Труда", "Долгопрудный" и "Петротрест". Все матчи завершались со счётом 2:0 в пользу "Локомотива-2". 

О фанатах ФК "Локомотив-2" нельзя говорить без упоминания фан-движения основного "Локомотива", ведь все кто ходит на "Локо-2" являются болельщиками первой команды.

"Локомотив-2" появился в начале 2008 года как фарм-клуб и заявился в любительскую лигу, сразу же  добившись права на повышение в классе. По началу, на матчи приходили в основном молодые ультрас-группы и болельщики, интересующиеся молодёжью "Локо",  то есть те, кто посещал встречи молодёжного состава. Игры проводились на одном маленьком стадионе Восточного округа Москвы. Атмосфера была хорошей, парни периодически делали баннеры посвященные команде, команда благодарила фанатов за поддержку, многие болельщики даже общались с футболистами не только в дни матчей. На матчах часто палилась пиротехника, иногда использовался барабан. В финале Кубка Москвы "Локомотив-2" играл с любительской командой и на этот матч собрались все ультрас-группы входящие в "UnitedSouth", устроили хорошее пирошоу и приготовили несколько баннеров, после матча все фанаты вышли на поле и сфотографировались с командой и тренерами. В конце сезона состоялся первый выезд в приделах Московской области – "Локо-2" провёл товарищеский матч с тверской "Волгой", на который отправилось около 200 человек. Апогеем стало файер-шоу, устроенное парнями.

К слову тренерами клуба являлись ветераны "Локомотива" – Евгений Харлачёв и Олег Пашинин.

В 2009 году "Локомотив-2" получил право выступать во Втором дивизионе, были подтянуты несколько опытных игроков, некоторое время в команде играли даже Руслан Нигматуллин и Юрий Дроздов, однако интерес у болельщиков к играм клуба понемногу начал спадать, игры проводились в будни, что не очень удобно для болельщиков. Клуб к удивлению ряда болельщиков занялся выпуском атрибутики — честно говоря, не совсем понятно, зачем фарм-клубу своя атрибутика. Игры стали проводиться на МСА "Локомотив". Выход во Вторую лигу подарил интересные выезда и ожидание дерби с "Торпедо", которое так и не объединилось, в итоге были игры с "ЗиЛом".

В зоне, где играл "Локомотив-2", присутствовали также московский САК, владимирское "Торпедо", на эти матчи собиралось большее количество зрителей, а в среднем в течение года посещаемость была небольшой – человек 400. Группы на "Локо-2" ходили все меньше, инициативу по поддержке в свои руки начали брать молодые парни, они делали первые в жизни баннеры, обсуждали возможность пирошоу на последний тур и т.п. На выездные игры часто приходили местные болельщики "Локомотива"  — в городах северо-запада России приезд пусть и фарм-клуба "Локо" радовал местных паровозов. По итогам сезона "Локомотив-2" занял 5 место в своей зоне, что стало очень даже хорошим результатом для дебютанта.

В сезоне-2010 во Вторую лигу вышло московское "Торпедо", и межсезонье для интересующихся прошло в ожидании в какую зону их заявят, в итоге заявили в "Центр", "Локо-2" остался в зоне "Запад". Клуб запустил показ матчей в интернете, заявил молодёжную команду в любительскую лигу, также выпустил ещё дизайн шарфов и главной задачей на сезон ставил выход в Первую лигу. Группа инициативных болельщиков, ранее особо не проявлявшая интереса к фарм-клубу, занялась организацией поддержки "Локо-2", в первой половине чемпионата почти на каждой игре появлялись баннеры, клуб организовывал бесплатные поездки в ближайшие города Подмосковья, однако к концу сезона активность несколько спала.